附屬醫院：

    第一附屬醫院

    附屬連雲港第二人民醫院

    附屬連雲港婦幼保健院

    附屬連雲港中醫院

    附屬連雲港東方醫院

    附屬贛榆醫院

    附屬泰興醫院

    附屬興化醫院

    附屬丹陽醫院

    附屬臨沂婦女兒童醫院

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    附属新沂人民醫院

    附属涟水人民醫院

臨床醫學院：

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    南通臨床醫學院

教学醫院：

    南京市溧水区人民醫院

    南京市浦口醫院

 南京市中心醫院

 泗洪县人民醫院 

 金湖县人民醫院

 滨海县人民醫院

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 响水县人民醫院

 扬中市人民醫院

 灌南县第一人民醫院

 连云港光明眼科醫院

 连云港灌云仁济醫院